因受到輻射而基因變異的科學家布魯斯·班納，仍然在想盡辦法尋找能夠治癒他那被毒害了的細胞的方法，布魯斯憤怒的時候，放肆的暴力傾向會讓他的身體機能迅速蠕動，變成一個力大無窮、像小山一樣高的綠色巨人，可是他不想這樣，即使他能夠得到神奇的超能力，卻寧可過回普通的平淡生活。
為了躲避美國軍方的追捕，布魯斯只好把自己藏在隱蔽的地方，與以前的生活、包括他心愛的女人貝蒂·羅斯完全切斷了聯絡，而緊隨在他之後的，正是貝蒂的父親--撒迪厄斯·羅斯將軍，這個冷酷的戰爭機器想要抓住布魯斯，就是為了研究他身體裡產生的異變，然後將這種力量據為己用。
隨著故事的發展，“綠巨人”為什麼會出現的謎底也漸漸浮出了水面，同樣的基因經過複製後，另一個變異人“憎恨”被製造出來了，同樣破壞力驚人，卻是一個令人討厭的畸形怪物，將會是“綠巨人”需要對抗的最有威脅性的敵人……
與此同時，布魯斯還必須得做出一個讓人苦惱的最終選擇：是重新當回普通的科學家？還是繼續揹負著那個一直隱藏在他內心深處的綠色生物，以求尋找到真正勇敢與俠氣並重的英雄氣節？
